Los niños que nacen con Síndrome de Down tienen todos ellos unas características físicas similares como hemos dicho:

• Fisura palpebral oblicua
• Pliegue epicanto
• Surco plantar entre el primer y segundo dedo del pie.
• Surco palmar único
• Braquicefalia
• Hipoplasia maxilar superior y protusión de la lengua
• Implantación baja de las orejas
• Puente nasal plano
• Manchas del iris (manchas de Brushfield)
• Braquidactilia, clinodactilia (alteraciones en los dedos)
• Hipotonía

Pueden presentar problemas asociados: malformaciones congénitas asociadas (cardiopatía, anomalías del aparato digestivo, cataratas congénitas) y patologías relacionadas con el propio crecimiento, especialmente alteraciones derivadas del retraso del desarrollo psicomotriz. Las dificultades de aprendizaje pueden complicarse con defectos sensoriales como hipoacusia (sordera) o defectos oculares de refracción o de alineación. Hacia la segunda infancia o la adolescencia el problema nutricional más importante es la obesidad debido a una ingesta excesiva acompañada de escaso ejercicio físico.

También pueden aparecer problemas dermatológicos, trastornos convulsivos, disfunción tiroidea y problemas ortopédicos, como luxación de cadera e inestabilidad atlantoaxoidea, debidas a la laxitud ligamentosa que acompaña a este síndrome.